年末調整は、会社に勤めている方で「給与所得者の扶養控除等（異動）申告書」を提出している方について、その年の最後の給与支払時に行うことになっています。

ただし、次の方は年の途中でも年末調整を行います。

(1)年の途中で死亡退職した方
(2)著しい心身の障害のため年の途中で退職した方で、本年中に再就職ができないと見込まれる方
(3)12月中に給与の支給があり、支払を受けた後に退職した方
(4)パートタイマーなどとして働いていた方が退職し、本年中に支払を受ける給与の総額が103万円以下である方（退職後本年中に他の勤務先等から給与の支払が見込まれる方を除く）
(5)年の途中で、海外の支店へ転勤したことなどの理由により、国内に住所も１年以上の居所も有しない方

(1)から(4)の方は退職時に、(5)の方は非居住者となった時に年末調整を行います。

年末調整の手順としては、

１、年末調整時までに支払の確定した本年分の給与総額の計算と徴収税額の計算を行う。
２、給与所得控除後の給与等の金額計算を「平成20年分の年末調整等のための給与所得控除後の給与等の金額の表」により算出。
３、各種保険料等の控除額の計算を行う。
４、「扶養控除等申告書」に基づき、平成20年分の配偶者控除額、扶養控除額、基礎控除額及び障害者等の控除額の合計額を算出。
５、「給与所得者の配偶者特別控除申告書」に基づき、配偶者特別控除額を算出。
６、前述２で求めた金額から３ないし５で求めた額を控除し、課税給与所得金額を算出。
７、６で求めた課税給与所得金額に応じて算出年税額を算出。

最後に年調年税額と毎月の給料や賞与から源泉徴収した本年中の源泉徴収税額の合計額と比べて過不足額を求めて精算を行います。

３については、社会保険料、小規模企業共済等掛金、一般の生命保険料及び個人年金保険料、地震保険料のそれぞれ全額または一定額が控除されます。また、５については、配偶者控除を受けている場合には、配偶者特別控除の適用は受けること ができませんのでご注意ください。

なお、住宅借入金等特別控除を受けている方（初年分は確定申告）は、住宅借入金等特別控除申告書に基づいて控除額を算出し、７で求めた算出年税額から控除して年調年税額を求め上記７と同様に精算を行います。 給与所得だけであっても、主たる給与の収入金額が2,000万円を超えたり、医療費控除を受ける場合などは確定申告を行っていただくことになります。

年末調整は年末の賞与計算と重なる場合が多いと思われますので、従業員の方々から証明書類を早めに提出していただくことを念頭に、綿密なスケジュールを立てて進めることが必要と思われます。